Tese de mestrado em Química, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2015; A descoberta de novos antibióticos que apresentem mecanismos de ação inovadores representa um dos principais desafios que a comunidade científica enfrenta, sobretudo devido à disseminação crescente de estirpes bacterianas resistentes às terapêuticas disponíveis. Neste contexto, o nosso grupo de investigação está particularmente interessado em explorar a potencial utilidade terapêutica de surfactantes derivados de açúcares enquanto agentes antibacterianos. Estas moléculas são conhecidas pela sua biocompatibilidade e por apresentarem baixa toxicidade ecológica, pelo que se consideram apropriadas para aplicações em medicina e na indústria. Em trabalhos anteriores, descrevemos uma série de 2-desoxi-/2,6-didesoxi-arabino-hexopiranósidos de alquilo [1–3], alguns dos quais exibiram actividades antibacterianas potentes e seletivas quando testadas em estirpes de Bacillus, nomeadamente B. cereus, B. subtilis e, em particular, B. anthracis, sendo o último considerado um agente de bioterrorismo. No entanto, o composto mais potente, 2,6-didesoxy-arabino-hexopiranósido de dodecilo, revelou também induzir toxicidade aguda em linfócitos humanos. Assim...

Tese de mestrado em Bioquímica, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2015; A microcalorimetria deteta o fluxo de calor associado à amostra analisada, sendo uma técnica com uma elevada sensibilidade e capaz de acompanhar o metabolismo celular em tempo real e em condições não-invasivas. Os resultados das experiências calorimétricas, regra geral, são apresentados sob a forma de curvas de fluxo de calor vs tempo (∆φ-t) ou de potência dissipada vs tempo (curvas P-t). A curva P-t associada ao crescimento de vários microrganismos, como a Saccharomyces cerevisiae, geralmente, com a glucose como fonte de carbono e energia já foi alvo de diversos estudos. É possível associar singularidades observadas na curva P-t a fenómenos biológicos específicos (ex: transição diáuxica) e analisar a resposta metabólica a vários stresses, como o efeito de antibióticos sobre vários microrganismos. Apesar de existirem evidências que sugerem que o metabolismo celular é altamente dinâmico e que a potência dissipada por célula varia ao longo do crescimento, este assunto tem sido ignorado. Aliás, é muito comum assumir que cada fase de crescimento tem uma potência dissipada por célula constante. O peróxido de hidrogénio (H2O2) é uma molécula biológica ubíqua que atua como sinalizador intracelular a doses baixas...

Fruto do reforço de processos de informalização e de individualização na conjugalidade e na parentalidade nas últimas décadas, hoje em dia a monoparentalidade tem uma maior incidência nos percursos familiares e representa uma maior diversidade de formas de viver a parentalidade e a coparentalidade a sós. Nesta comunicação, pretende-se caraterizar as famílias monoparentais nos Censos 2011 e identificar continuidades e mudanças na monoparentalidade com filhos menores de 18 anos nas duas últimas décadas. A análise revela que, em 2011, se regista um aumento das famílias monoparentais, sobretudo das famílias com filhos menores de 18 anos. A co-residência dos pais e das mães sós com familiares próximos mantém-se elevada, embora a co-residência apenas com os filhos continue a aumentar. Permanece a preponderância das famílias de mães sós em relação às de pais sós. A rutura conjugal torna-se a principal forma de entrada na monoparentalidade, em detrimento da monoparentalidade por viuvez, agora minoritária. Aumenta a escolaridade nestas famílias, mas cerca de metade só possui escolaridades até o 3º ciclo. O emprego mantém-se elevado, porém são mais atingidas pelo desemprego do que a população ativa em geral. Conclui-se que...

Tese de mestrado, Biologia (Biologia Molecular e Genética), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015; The skin is the largest organ of the human body. From ancient times, the color of skin has been an intriguing feature. Moreover, a large number of diseases are associated with skin disorders such as Griscelli syndrome, Hermansky-Pudlak syndrome and Waardenburg syndrome. Therefore, therapies directed to pigmentation disorders and also cosmetic applications have been intensively studied. Thus it is essential to understand the molecular mechanisms underlying of pigmentation disorders. The “epidermal-melanin unit” is the functional complex that confers color and photoprotective properties to the skin. This unit is composed by melanocytes and keratinocytes. Epidermal melanocytes are highly specialized cells that synthesize and store the pigment melanin in unique membrane-bound organelles termed melanosomes. Once mature, melanosomes are transferred to neighbor keratinocytes and transported to the apical area of the cell where they form the protective melanin cap. Skin pigmentation results from three sequential processes: (i) the biogenesis of melanin in melanocytes; (ii) the transport from its site of synthesis in the perinuclear area of the cell to the periphery; and finally...

Tese de mestrado, Biologia (Biologia Molecular e Genética), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015; Clostridium difficile is the leading cause of antibiotic-associated diarrhea in developed countries. Elderly hospitalized patients taking antibiotics are the main group at risk of infection. Since 2000, several countries have reported an increased incidence and severity of CDI associated with the emergence of the epidemic RT027. This clone produces Toxin A (TcdA), Toxin B (TcdB) and an additional binary toxin, Clostridium difficile transferase (CDT), has a deletion at position 117 in the tcdC gene (negative regulator of toxin production) and is highly resistant to fluoroquinolones. However, CDI epidemiology is highly variable, as other hypervirulent RTs have also started to emerge, and is still largely unknown in our country. In the present study, 286 C. difficile strains sent from 22 Portuguese hospitals were characterized regarding PCR ribotype, toxin profile, tcdC mutations, antimicrobial susceptibility to MXF, VAN, MTZ, IMP, RIF and TGC, and mechanisms of antimicrobial resistance. Most patients (73.4%) were aged ≥65 years and at least 54.9% had taken antibiotics in the previous months; 76.5% of the cases were healthcare facility-associated (HCFA) and 12.6% were community-associated (CA). Among the 84 distinct RTs found...

Tese de mestrado, Biologia (Biologia da Conservação), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015; A crescente expansão da área ocupada por florestas de produção está estreitamente associada ao aumento do consumo de produtos lenho-celulósicos, sendo as espécies do género Eucalyptus frequentemente escolhidas a nível mundial para a sua implementação. Contudo, as características do eucalipto em si e a gestão intensiva das suas plantações podem impor constrangimentos à fauna local. O presente trabalho foi realizado na plantação de eucaliptos da Charneca do Infantado, propriedade da Companhia das Lezírias, S.A.. Este teve como objectivo avaliar a influência do subcoberto na riqueza e diversidade específicas, presença e abundância relativa de micromamíferos e estrutura populacional (sexual e etária) das suas populações. Para tal, foram capturados micromamíferos em vários pontos de armadilhagem. Para cada um desses pontos foi estimada a percentagem de cobertura do estrato arbustivo, estrato herbáceo e solo nu / manta morta, e medidas as distâncias à orla, caminho, estrada, unidade de paisagem com outro tipo de vegetação e zonas húmidas mais próximas, sendo estas as variáveis independentes consideradas na análise. Devido ao facto de a amostragem incidir em duas épocas (Outono e Primavera)...

Tese de mestrado, Biologia (Biologia da Conservação), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015; A falta de informação que ainda existe sobre as populações de roazes-corvineiros (Tursiops truncatus) que habitam estuários influencia a compreensão do estatuto vulnerável das mesmas. Este é resultado das ameaças antropogénicas a que estão sujeitas pela localização próxima de zonas urbanas e industrializadas. Existiu assim um esforço de estudo e inovação tecnológica na análise das mudanças ambientais antropogénicas que influenciam as interacções dos organismos com os elementos do seu ambiente. No caso particular dos animais marinhos, a utilização de informação espacial sobre a forma de mapas torna-se essencial pela falta de informação, que muitas vezes existe sobre os seus movimentos e utilização do habitat. O trabalho aqui apresentado tem assim como objectivo a elaboração do mapa de aplicabilidade do método goniométrico no interior do estuário do Sado e linha costeira imediatamente adjacente, usado no estudo da utilização espacial do estuário pela população residente de roazes. Foi assim usado o método goniométrico para observação e posicionamento dos roazes e para definição dos valores limite de leitura no interior do estuário...

Tese de mestrado em Biologia da Conservação, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2015; Os ciprinídeos (Cyprinidae) constituem a família mais numerosa de peixes de água doce, tendo uma distribuição a nível global e ocupando uma grande diversidade de nichos ecológicos. Na Península Ibérica, encontram-se representados por um grande número de espécies endémicas, a maioria das quais com estatutos de conservação elevados. Para além das ameaças inerentes aos ecossistemas fluviais (e.g. poluição, proliferação de espécies exóticas e destruição de habitats) e do carácter intermitente de grande parte dos rios da região, os ciprinídeos ibéricos apresentam, na sua grande maioria, populações fragmentadas e com reduzida diversidade genética, o que potencia o seu risco de extinção. O ruivaco-do-Oeste Achondrostoma occidentale é uma das espécies endémicas de Portugal que se encontra fortemente ameaçada. Este pequeno ciprinídeo apresenta uma distribuição muito restrita, limitada às ribeiras do Alcabrichel, Sizandro e Safarujo, onde as populações já com baixa diversidade genética enfrentam ainda graves problemas de poluição das águas e destruição de habitats. Face à situação de risco do ruivaco-do-Oeste e ao contexto de seca ocorrido em Portugal em 2006...

Tese de mestrado em Ecologia e Gestão Ambiental, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2015; O mar desempenha um papel muito importante para a civilização humana, sendo utilizado para diversos fins, tais como meio de transporte, fonte de alimento e de recursos naturais vivos e não vivos, lazer, turismo, entre outras atividades e usos. A exploração, aumento do conhecimento e desenvolvimento de novos meios de aproveitamento dos recursos marítimos difundiu o interesse no oceano enquanto vetor de desenvolvimento estratégico económico, social e ambiental. A crescente procura do espaço marítimo para o desenvolvimento de diversas atividades e usos e o aparecimento da política da União Europeia para o “Crescimento Azul” impulsionaram a criação de instrumentos legais que acomodassem a nova visão do mar, de modo a garantir um espaço marítimo saudável, eficaz e sustentável. Consequentemente, vários países iniciaram o processo de desenvolvimento de instrumentos legais que incorporassem as diretrizes europeias, incluindo as políticas para o ordenamento do espaço marítimo, indicado na estratégia para o crescimento azul como uma das vertentes essenciais em matéria de política marítima integrada. Portugal tem sido um país líder no processo de ordenamento do espaço marítimo...

Tese de mestrado, Biologia (Biologia Molecular e Genética), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015

Tese de mestrado, Biologia (Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015; Em Drosophila melanogaster, após a eclosão do ovo, a larva desenvolve-se ao longo de três estádios larvares, que são seguidos pela formação da pupa, terminando assim a fase de crescimento. O tempo das várias transições do desenvolvimento do insecto é influenciado por factores ambientais e é regulado pela hormona esteroide, ecdisona. Os padrões de crescimento e morfogénese a que o animal é sujeito durante o período de desenvolvimento são determinados e, portanto, previsíveis. No entanto, para que seja produzido um organismo com dimensões corporais apropriadas e em sintonia com o ambiente, estes processos podem ser afectados por condições extrínsecas (como a nutrição) ou por perturbações intrínsecas que ocorram, por exemplo, durante a regeneração de um órgão e/ou tecido. Esta capacidade que um organismo tem de lidar com estas perturbações, refletindo proporções corporais corretas é designada por estabilidade de desenvolvimento. Esta é uma propriedade muito relevante para o desenvolvimento, pois a alteração das dimensões corporais e/ou de órgãos de um animal pode afectar a sua fitness e...

Tese de mestrado, Biologia (Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015; Diferentes estudos desenvolvidos pelo nosso grupo envolveram colonização com Helicobacter hepaticus (Hh) reproduzindo um tipo de interação hospedeiro-microorganismo. Dados anteriores aos que são apresentados neste projeto reportaram que após a colonização com Hh em ratos adultos saudáveis B6 WT é desencadeada uma resposta robusta de imunoglobulina (Ig) específica contra Hh, acompanhada por uma redução da densidade bacteriana (dados não pulicados). Também foi observado que é necessária uma resposta de células B dependente de células T para controlar a densidade de Hh e que a citoquina responsável pela persistência de Hh, IL-10, é essencial para modular esta resposta. Curiosamente, aquando da colonização com esta bactéria em ratos neonatos B6 WT, a resposta de Igs específicas não se verificou e estes animais apresentaram densidades elevadas de Hh. Por fim, a tolerância a Hh – mediada por IL-10 e sustentada por células T regulatórias CD25+ – foi mantida mesmo quando os animais atingiram a idade adulta (dados não publicados). Tendo em conta as evidências referidas acima, o grande foco deste trabalho residiu no contraste entre a colonização com Hh no período neonatal e no adulto. Neste contexto...

Tese de mestrado, Biologia (Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015; Understanding speciation requires the integration of ecology, evolution and the role of history in shaping the diversification or decline of lineages. To gain understanding on how variation is generated and maintained within and between natural populations, we must understand both how variation in phenotype may affect the fitness of individuals in their local environment, and how natural selection is shaping the genome of those organisms. Next generation sequencing together with new analytical approaches have fundamentally changed the scope of studies of non-model organisms and thus, the available tools to answer long-standing questions underwent remarkable evolution. We are now, more than ever before, equipped to establishing missing links between phenotype, genotype and environment, which will provide a detailed picture of the adaptive evolutionary process. Studies of the genomics of speciation along the speciation continuum are emerging in several non-model organisms, mainly where speciation is driven by ecology and divergent selection. The present study was the first applying RAD-Seq to natural populations of Timon lepidus...

Tese de mestrado, Biologia (Biologia Molecular e Genética), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015; The Human genome comprises almost 8% long terminal repeat (LTR)-retroelements, in which Human Endogenous Retroviruses (HERVs) are included. More than 30 HERV groups have been identified. They share a similar provirus structure with exogenous retroviruses, despite harboring many inactivating mutations. Interestingly, HERVs have been increasingly associated with cancer, autoimmunity and infectious diseases. Data on HERV expression in T cells is sparse. Here we investigated, for the first time, the expression of several HERV families during human T cell development and differentiation. HERV-K, -W, -P and -R envelope (env) expression were analyzed in purified T cell subsets from the human thymus, peripheral blood or tonsils using real time RT-PCR. In addition, Env protein expression was studied in thymic and tonsillar tissue using immunohistochemistry. We observed a similar pattern of HERV env transcriptional expression during the development and maturation of thymocytes in the thymus. HERV levels tended to be higher in mature thymocytes than in the early developmental stages, supporting their differential regulation during T cell development. Regarding the peripheral blood compartment...

Tese de mestrado em Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2015; A malária é uma doença potencialmente fatal provocada por parasitas do género Plasmodium. Os eritrócitos infetados por Plasmodium exibem antigénios na superfície membranar que se ligam a receptores do endotélio vascular, permitindo a adesão destes eritrócitos infectados a órgãos específicos. Durante a gravidez, as mulheres revelam uma maior suscetibilidade à infecção pelo parasita da malária. Esta suscetibilidade acrescida resulta em consequências negativas tanto para a progenitora como para o(s) neonato(s). Os eritrócitos de mulheres grávidas infectados por Plasmodium falciparum (o mais agressivo dos parasitas do género Plasmodium que infectam humanos) apresentam antigénios na sua superfície que permitem a ligação à placenta, através de recetores aí existentes, como o sulfato de condroitina A (CSA). O CSA interage com VAR2CSA (antigénio presente na superfície de eritrócitos infectados em mulheres grávidas expostas a Plasmodium falciparum). A aquisição natural de anticorpos contra VAR2CSA está associada à ausência de sintomas de malária placentária. Os níveis de anticorpos contra VAR2CSA aumentam ao longo da gravidez e ao longo de sucessivas gravidezes...

Tese de mestrado em Biologia da Conservação, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2015; Nos trópicos, o acréscimo da desflorestação está a originar paisagens compostas por fragmentos de pequenas dimensões de floresta natural (floresta primária) circundada por uma matriz de habitat modificado. A sazonalidade nos trópicos é marcada por diferenças na precipitação, sendo que estas diferenças entre a estação seca e húmida podem levar a alterações na produtividade primária, no crescimento e nos padrões de frutificação e floração de algumas plantas tropicais. Estas mudanças na produção primária podem provocar oscilações na disponibilidade de recursos, afetando a presença e a abundância não apenas de espécies frugívoras e nectarívoras, mas também de espécies insectívoras. Quando a sazonalidade atua conjuntamente com a fragmentação, os impactos da última sobre a biodiversidade podem ser agravados. Isto acontece porque as flutuações naturais na disponibilidade de recursos podem ser alteradas tanto por diferenças nas condições microclimáticas nas bordas dos fragmentos como pela matriz de habitat modificada ação humana. Adicionalmente, a fragmentação pode ainda impedir migrações sazonais e diminuir o acesso a recursos essenciais...

Tese de mestrado em Biologia Humana e Ambiente, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2015; A aterosclerose é uma doença crónica inflamatória que afecta as paredes dos vasos onde ocorre a formação de placas de ateroma. Estas placas de ateroma são o resultado da acumulação de lípidos, células inflamatórias, resíduos celulares e cálcio e, consequentemente há um aumento do risco para a ocorrência de eventos cardiovasculares. A aterosclerose inicia-se com a disfunção das células endoteliais e expressão de VCAM-1 (Vascular Cell-Adhesion Molecule 1) ao qual se ligam monócitos e células T que migram para o tecido arterial, aumentando a produção de citocinas, factores de crescimento, acumulação de lípidos, proliferação de células do músculo liso e aumento da secreção de moléculas de adesão. Estes eventos todos reunidos levam à formação de células espumosas pró-inflamatórias e culmina na formação das placas de aterosclerose. Os factores de risco para a ocorrência desta doença são vários, entre os quais destacam-se o aumento da idade, o sexo masculino, hábitos tabágicos, problemas de hipertensão, dislipidémia, outras doenças como a diabetes mellitus e também alterações genéticas próprias de cada indivíduo. O processo inflamatório está na base desta doença que é mediada por várias citocinas pró-inflamatórias...

Tese de mestrado em Biologia Humana e Ambiente, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2015; As doenças que afectam o sistema cardiovascular e o osso estão entre as doenças que causam maior morbilidade e mortalidade na população, em especial a aterosclerose e a osteoporose. Vários estudos epidemiológicos têm demonstrado que estas duas doenças podem estar relacionadas de alguma forma, uma vez que ambas as patologias estão normalmente presentes no mesmo doente. Doentes com patologia cardiovascular apresentam um risco 1.2 a 6.7 vezes maior de sofrer de fraturas de fragilidade comparando com a população em geral, e esta associação também foi demonstrada em doentes com uma massa óssea reduzida que têm um risco aumentado de desenvolver doenças ao nível cardiovascular, em especial doentes com doenças autoimunes como lúpus eritematoso sistémico ou a artrite reumatoide. A aterosclerose é caracterizada pela acumulação de partículas lipídicas e células do sistema imunitário que levam ao estreitamento do lúmen das artérias, e numa fase mais avançada do processo pode ocorrer ruptura destas placas ateroscleróticas com possível formação de trombos. Estudos recentes têm demostrado o envolvimento do sistema imune na patogénese da aterosclerose. Este processo é iniciado pelos monócitos que posteriormente se diferenciam em macrófagos com capacidade de acumular lípidos no citoplasma formando as conhecidas foam cells...